Die Insel steht als UNESCO-Weltnaturerbe unter strengem Schutz und profitiert von ihrer isolierten Lage mitten im Pazifik. Mehrere große Meeresströmungen treffen hier aufeinander und transportieren enorme Mengen an Nährstoffen in die Region. Genau diese Bedingungen machen Malpelo zu einem Magneten für Hammerhaie, Seidenhaie, Galapagoshaie, Walhaie, Thunfische und riesige Fischschwärme. Zwischen Juni und Oktober ziehen häufig legendäre Schulen von Hammerhaien durch die Gewässer rund um die Insel und sorgen für jene Bilder, für die Malpelo weltweit berühmt geworden ist.

Tauchsafaris nach Malpelo richten sich ausschließlich an erfahrene Taucher. Die Überfahrt ist lang, die Bedingungen können anspruchsvoll sein und Strömungen gehören vielerorts zum Tauchalltag. Sichtweiten und Wassertemperaturen werden stark von den wechselnden Meeresströmungen beeinflusst und können sich innerhalb kurzer Zeit deutlich verändern. Genau diese Unberechenbarkeit macht jedoch auch den Reiz der Insel aus. Wer Malpelo unter guten Bedingungen erlebt, findet eine Unterwasserwelt vor, die in ihrer Dichte an Haien und Großfischen selbst unter den besten Tauchrevieren der Erde eine Ausnahmeerscheinung darstellt.